ÁREA DE CULTIVO DE ALIMENTO VIVO

Proporcionar apoyo durante las investigaciones asociadas a las líneas de investigación, referentes a la alimentación inicial de organismo en cultivo, de manera particular en estadios larvarios, donde el alimento vivo es la base fundamental de la actividad. Diagnósticos de la productividad primaria de cuerpos de agua, y su estado de salud en función de la biota asociada a los mismos. Estudios de impacto ambiental asociados a la productividad de los sistemas acuáticos.
ÁREA DE CULTIVO DE CRUSTÁCEOS NATIVOS

Realizar investigación básica y aplicada, para el desarrollo de biotecnología sustentable para el cultivo de diversos crustáceos de interés comercial, además de la preservación de especies nativas, con el propósito de promover la producción de crustáceos locales y evitar en lo posible, la introducción de especies exóticas y del efecto que puedan generar sobre el medio ambiente.
ÁREA EXPERIMENTAL DE ACUACULTURA APLICADA

Realizar actividades de investigación, docencia y vinculación relacionadas con el mantenimiento, reproducción, y cultivo con moluscos bivalvos, peces, además de manejo poscosecha de especies acuícolas para incrementar su valor agregado.
ÁREA DE MEJORAMIENTO GENÉTICO Y PRODUCCIÓN ACUÍCOLA

Incrementar la producción de organismos acuáticos, con base a la selección y potencialización de características importantes para la acuacultura de las especies, a través de la utilización de metodologías derivadas de la genética cuantitativa.
ÁREA DE TOXICOLOGíA ACUÁTICA

Desarrollar procesos de investigación dirigidos a la solución de problemas toxicolígicos en el campo acuícola. Validar técnicas analíticas para ampliar la cobertura de servicios de acuerdo con las demandas del sector acuícola y pesquero, así como otros que requieran de servicios. Realizar investigación para la evaluación y cuantificación de los parámetros físicoquímicos y biológicos asociados a la calidad del agua en que habitan los organismos de los diferentes sistemas acuáticos.
ÁREA DE NUTRICIÓN ACUÍCOLA

Tiene como objetivo brindar apoyo técnico a los proyectos de investigación y desarrollo tecnológico mediante el análisis de materiales e ingredientes usados durante las actividades acuícolas, para optimizar la nutrición de organismos en cultivo.
ÁREA DE HISTOLOGÍA Y RECURSOS ACUÁTICOS

Generar el conocimiento básico y aplicado para la prevención y control de enfermedades de moluscos acuáticos de interés comercial. Este conocimiento permitirá fomentar el desarrollo sustentable de la acuacultura mediante la prevención de la sanitaria en las zonas de incidencia y con potencial acuícola de la región.
ÁREA DE MICROBIOLOGÍA Y BIOLOGÍA MOLECULAR

Desarrollar técnicas de diagnóstico y control de microorganismos patógenos que afecten a la industria de la acuacultura o la calidad sanitaria del agua, mediante la aplicación de técnicas microbiológicas normadas (NMXs y NOMs) y herramientas biotecnológicas innovadoras.
ÁREA DE CULTIVO DE PECES

El objetivo del área de Cultivo de Peces, es el desarrollo de investigación con especies de peces exóticas y nativas de importancia en la acuacultura o con potencial de cultivo. Realizar investigación acerca de la biología, ecología, diagnóstico, prevención y control de agentes infecciosos parasitarios en organismos acuáticos, silvestres y de importancia acuícola o con potencial de cultivo.